Protein–RNA interactions for Protein: O60813

PRAMEF11, PRAME family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF11O60813 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRAMEF11O60813 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRAMEF11O60813 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF11O60813 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms