Protein–RNA interactions for Protein: O60662

KLHL41, Kelch-like protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL41O60662 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL41O60662 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLHL41O60662 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL41O60662 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms