Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD2O60548 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD2O60548 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD2O60548 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms