Protein–RNA interactions for Protein: O15446

CD3EAP, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD3EAPO15446 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD3EAPO15446 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD3EAPO15446 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD3EAPO15446 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms