Protein–RNA interactions for Protein: O14815

CAPN9, Calpain-9, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN9O14815 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPN9O14815 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN9O14815 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN9O14815 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN9O14815 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms