Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PTPRTO14522 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
PTPRTO14522 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.2■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PTPRTO14522 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
PTPRTO14522 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTPRTO14522 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
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