Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOC4-APOC2K7ER74 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
APOC4-APOC2K7ER74 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
APOC4-APOC2K7ER74 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms