Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
H7C1D1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
H7C1D1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H7C1D1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H7C1D1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
H7C1D1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
H7C1D1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
H7C1D1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
H7C1D1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1D1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1D1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1D1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1D1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1D1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1D1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
H7C1D1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
H7C1D1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
H7C1D1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
H7C1D1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1D1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1D1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1D1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1D1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
H7C1D1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1D1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1D1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1D1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1D1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1D1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1D1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
H7C1D1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1D1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1D1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1D1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1D1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1D1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1D1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1D1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1D1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
H7C1D1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H7C1D1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H7C1D1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
H7C1D1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
H7C1D1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1D1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1D1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1D1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1D1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
H7C1D1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1D1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1D1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1D1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1D1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1D1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1D1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1D1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1D1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
H7C1D1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
H7C1D1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
H7C1D1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
H7C1D1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
H7C1D1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
H7C1D1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
H7C1D1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
H7C1D1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1D1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1D1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1D1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1D1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1D1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
H7C1D1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1D1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1D1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1D1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1D1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1D1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
H7C1D1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
H7C1D1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
H7C1D1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1D1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1D1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1D1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1D1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
H7C1D1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
H7C1D1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
H7C1D1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
H7C1D1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1D1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1D1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
H7C1D1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms