Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms