Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LRRC10BA6NIK2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LRRC10BA6NIK2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LRRC10BA6NIK2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms