Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN8

Putative ubiquitin-like protein FUBI-like protein ENSP00000310146, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NDN8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
A6NDN8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A6NDN8 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A6NDN8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
A6NDN8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A6NDN8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A6NDN8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A6NDN8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A6NDN8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NDN8 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NDN8 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NDN8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NDN8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NDN8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NDN8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NDN8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NDN8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NDN8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NDN8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
A6NDN8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A6NDN8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A6NDN8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NDN8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NDN8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NDN8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NDN8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NDN8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NDN8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NDN8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NDN8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NDN8 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
A6NDN8 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NDN8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NDN8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NDN8 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NDN8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NDN8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NDN8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NDN8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
A6NDN8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NDN8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NDN8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NDN8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NDN8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NDN8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NDN8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NDN8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
A6NDN8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms