Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
XIRP2A4UGR9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
XIRP2A4UGR9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
XIRP2A4UGR9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
XIRP2A4UGR9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms