Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SSPOA2VEC9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
SSPOA2VEC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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