Protein–RNA interactions for Protein: A1X283

SH3PXD2B, SH3 and PX domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3PXD2BA1X283 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH3PXD2BA1X283 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3PXD2BA1X283 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SH3PXD2BA1X283 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms