Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J2E0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J2E0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
A0A0B4J2E0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A0A0B4J2E0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A0A0B4J2E0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms