Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H8

IGKV1D-42, Immunoglobulin kappa variable 1D-42 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-42A0A075B6H8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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IGKV1D-42A0A075B6H8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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IGKV1D-42A0A075B6H8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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IGKV1D-42A0A075B6H8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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IGKV1D-42A0A075B6H8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGKV1D-42A0A075B6H8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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IGKV1D-42A0A075B6H8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-42A0A075B6H8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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IGKV1D-42A0A075B6H8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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IGKV1D-42A0A075B6H8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-42A0A075B6H8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-42A0A075B6H8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-42A0A075B6H8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGKV1D-42A0A075B6H8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGKV1D-42A0A075B6H8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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IGKV1D-42A0A075B6H8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IGKV1D-42A0A075B6H8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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IGKV1D-42A0A075B6H8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
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