Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TRAF6Q9Y4K3 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRAF6Q9Y4K3 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRAF6Q9Y4K3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRAF6Q9Y4K3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRAF6Q9Y4K3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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TRAF6Q9Y4K3 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRAF6Q9Y4K3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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TRAF6Q9Y4K3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRAF6Q9Y4K3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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