Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SH3BP1Q9Y3L3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SH3BP1Q9Y3L3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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SH3BP1Q9Y3L3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SH3BP1Q9Y3L3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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SH3BP1Q9Y3L3 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SH3BP1Q9Y3L3 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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