Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TTF2Q9UNY4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms