Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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COPS3Q9UNS2 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
COPS3Q9UNS2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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