Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms