Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RIMS3Q9UJD0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms