Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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CPNE7Q9UBL6 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CPNE7Q9UBL6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CPNE7Q9UBL6 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CPNE7Q9UBL6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CPNE7Q9UBL6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CPNE7Q9UBL6 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CPNE7Q9UBL6 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CPNE7Q9UBL6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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CPNE7Q9UBL6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CPNE7Q9UBL6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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