Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
KLHL13Q9P2N7 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms