Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

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Length 774 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
HCN3Q9P1Z3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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