Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms