Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GDE1Q9NZC3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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