Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PSD3Q9NYI0 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PSD3Q9NYI0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 881.6 ms