Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
THUMPD1Q9NXG2 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms