Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RHBDL2Q9NX52 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RHBDL2Q9NX52 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms