Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CHST12Q9NRB3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CHST12Q9NRB3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms