Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ76

MEPE, Matrix extracellular phosphoglycoprotein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEPEQ9NQ76 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
MEPEQ9NQ76 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
MEPEQ9NQ76 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms