Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM5Q9C035 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms