Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCD2Q9BXW9 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCD2Q9BXW9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCD2Q9BXW9 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FANCD2Q9BXW9 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FANCD2Q9BXW9 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms