Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BRIP1Q9BX63 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms