Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
RTKNQ9BST9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms