Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TIMM29Q9BSF4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms