Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRJ9

MESP1, Mesoderm posterior protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1Q9BRJ9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
MESP1Q9BRJ9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176 ms