Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EBF4Q9BQW3 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms