Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FYCO1Q9BQS8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms