Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NSMCE2Q96MF7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NSMCE2Q96MF7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms