Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SAMD8Q96LT4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SAMD8Q96LT4 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SAMD8Q96LT4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SAMD8Q96LT4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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