Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SLC35A4Q96G79 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLC35A4Q96G79 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms