Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TM4SF19Q96DZ7 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM4SF19Q96DZ7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms