Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NMD3Q96D46 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms