Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SDCCAG3Q96C92 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SDCCAG3Q96C92 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SDCCAG3Q96C92 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SDCCAG3Q96C92 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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SDCCAG3Q96C92 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SDCCAG3Q96C92 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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SDCCAG3Q96C92 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SDCCAG3Q96C92 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SDCCAG3Q96C92 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SDCCAG3Q96C92 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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