Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMARCE1Q969G3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms