Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00612Q8N6U2 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms