Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCDC71Q8IV32 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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