Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5L3

GDPD3, Lysophospholipase D GDPD3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD3Q7L5L3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
GDPD3Q7L5L3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms