Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SPOCD1Q6ZMY3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SPOCD1Q6ZMY3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms